Podgrevanje krompira, kao i pirinča, može biti bezbedno ako se namirnice pravilno čuvaju, ali ključni problem nastaje kada kuvani krompir ostane na sobnoj temperaturi, posebno ako je prekriven aluminijumskom folijom ili sličnim materijalima. Naime, u takvim uslovima krompir postaje povoljan za rast i razvoj bakterija od kojih je najopasnija Clostridium botulin. Ova bakterija može izazvati ozbiljno trovanje hranom, poznato kao botulizam, koje može imati ozbiljne zdravstvene posledice.
Iako ponovno zagrevanje može da ubije mnoge bakterije, Clostridium botulinum može da preživi visoke temperature, čineći podgrevanje kuvanog krompira nedovoljno bezbednim za konzumiranje. Stoga, iako je podgrevanje praktično, podgrevanje krompira koji je nepravilno uskladišten može izazvati ozbiljne zdravstvene probleme.
Međutim, postoji izuzetak. Krompir koji je nakon kuvanja ohlađen i čuvan u frižideru, kao što je slučaj sa krompir salatom, zapravo može imati zdravstvene koristi.
Hlađenjem krompira skrob u njemu prelazi u tzv „otporni skrob“, koji je otporan na varenje i deluje kao prebiotik. Ovaj otporni skrob hrani korisne bakterije u probavnom sistemu, poboljšava zdravlje creva i promoviše bolje varenje.